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基于网络药理学与GEO芯片探究痹祺胶囊治 [复制链接]

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摘要:目的利用网络药理学、分子对接方法和GEO芯片探究痹祺胶囊治疗类风湿关节炎的网络调控机制。方法使用TCMSP数据库和SwissTargetPrediction平台收集和筛选痹祺胶囊的活性成分及其作用靶点。使用GEO数据库收集类风湿关节炎差异基因。将痹祺胶囊作用靶点与类风湿关节炎差异表达基因取交集确定痹祺胶囊治疗类风湿关节炎的潜在基因。通过Cytoscape3.8.0软件构建“中药-活性成分-靶点-疾病”网络和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。通过R软件对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用AutoDockvina软件对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果筛选得到痹祺胶囊治疗类风湿关节炎的潜在靶点36个,主要涉及钙离子内稳态、炎症反应、前列腺素受体的活动等生物过程,通过参与钙信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等来发挥治疗类风湿关节炎的作用,分子对接结果表明排名前10的主要活性成分与核心靶点ADRB2、EGFR、PPARG均具有较强的结合能力。结论痹祺胶囊治疗类风湿关节炎通过参与钙信号通路、TNF信号通路等来发挥治疗类风湿关节炎的作用,排名前10的主要活性成分与核心靶点ADRB2、EGFR、PPARG均具有较强的结合能力。

类风湿关节炎(rheumatoidarthritis,RA)是一种以侵蚀性关节炎为主要临床表现的自身免疫疾病,基本病理表现为滑膜炎、血管翳形成,并逐渐出现关节软骨和骨破坏,最终导致关节畸形和功能丧失[1]。RA是所有慢性炎症性关节疾病中最常见的一种,全球RA的发病率为0.5%~1.0%[2],中国大陆地区发病率为0.42%[3]。目前临床指南推荐联合使用抗风湿药物如甲氨蝶呤作为一线治疗药物[4]。但甲氨蝶呤起效较慢,且长期应用会产生肝功能受损、胃肠道反应、白细胞减少等不良反应[5]。目前西医治疗方法并不能彻底治愈RA,而且对患者产生的副作用也比较大。RA属于“痹证”范畴,在古代文献中对其有“骨痹”“鹤膝风”“鼓槌风”等描述。痹祺胶囊出自汉代华佗传世验方“一粒仙丹”,用于治疗水湿之地百姓常见的骨病。痹祺胶囊由马钱子、*参、茯苓、白术、丹参、地龙、三七、牛膝、川芎、甘草组成,Meta分析表明痹祺胶囊治疗RA疗效切确[6]。多项临床研究表明痹祺胶囊治疗RA效果良好,且不良反应较少,是治疗RA安全有效的方药[7-9]。然而痹祺胶囊治疗RA的机制尚不明确,这是限制其广泛应用的主要因素。

中药复方具有多化合物、多靶点的特点,多靶点、多途径、多环节治疗疾病。由于中药化学成分复杂,传统的研究方法难以充分阐明中药的作用机制。网络药理学为解决这一问题提供了一种方法,适用于中药多复方、多靶点的研究[10]。本研究从网络药理学和分子对接的角度探讨痹祺胶囊对RA的作用机制,为进一步的基础和临床研究提供方向。

1材料与方法

1.1收集痹祺胶囊成分和作用靶点

通过检索中药系统药理学数据库(

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